Reakcija vezana uz IgE antitijela 

Mehanizam alergijske reakcije isti je u svim navedenim oblicima. Riječ je o tipu I. alergijske reakcije vezane uz specifična IgE antitijela u krvi bolesnika koja se vežu s antigenom iz hrane i izazivaju pucanje mastocita te oslobađanje medijatora alergijske reakcije, od kojih je najvažniji histamin. Mastociti se u izobilju nalaze u koži, ali i u svim unutarnjim organima, pa tako i u cijelom probavnom sustavu, koji je po površini, od usta do analnog otvora, najveća površina sluznice u organizmu. Za razliku od stanica kože, zbog dobre prokrvljenosti i nezaštićenosti stanica sluznice, površina sluznice probavnog sustava puno jače resorbira alergene, pa tako na njih i reagira. U našem tijelu postoje i dvije vrste receptora za histamin - H1 (brojni organi - respiratorni, koža) i H2 receptori u cijelom probavnom sustavu, na koje se tijekom liječenja često zaboravlja.

Uz tipične alergološke mehanizme, postoji i pojam intolerancije (nepodnošljivost na neke vrste hrane - laktozu, glutene ili posebno na histamin, što je sve učestalije - kod koje je riječ o nealergijskoj reakciji, pa sve naše dijagnostičke metode ostaju bez rezultata).